En 1575, dans un couvent qu’administre Thérèse d’Avila, la rumeur publique affirme : une religieuse porte sur son corps les stigmates du Christ. Pour la Sainte Inquisition espagnole, cela ne peut être qu’une ruse du Démon ; mais pour la religieuse, c’est au contraire une grâce divine. S’ensuit une lutte entre le pouvoir religieux et les plus hautes juridictions pour déterminer si cette sœur est sincère, possédée ou à l’origine d’une vaste supercherie.
Le narrateur de ces événements, Lorenzo de Cepeda, riche marchand de retour d’un long périple en mer du Japon, n’est autre que le propre frère de Thérèse d’Avila. À son insu, il se verra entraîné dans la plus incroyable des énigmes de la chrétienté de ce temps : les stigmatisés. Déchiré entre la foi que prêche sa sœur et les guerres sans partage que se livrent les ordres religieux, don Lorenzo oscillera sans cesse entre certitude et doute, renoncement et devoir…